中国科学院水利部水土保持研究所成立于1956年，是中国科学院在西北地区建立的第一个科研机构。1987年由中国科学院和水利部双重管理，1995年经国家批准确定现所名。1998年被中国科学院列入国家知识创新工程首批试点单位。1999年根据国务院文件，与杨凌其它6个科教单位合并组建“西北农林科技大学”。2001年中国科学院与教育部联合共建“水土保持与生态环境研究中心”，作为知识创新工程试点单位继续纳入中国科学院研究机构序列。
中国科学院水利部水土保持研究所成立于1956年，是中国科学院在西北地区建立的第一个科研机构。1987年由中国科学院和水利部双重管理，1995年经国家批准确定现所名。1998年被中国科学院列入国家知识创新工程首批试点单位。1999年根据国务院文件，与杨凌其它6个科教单位合并组建“西北农林科技大学”。2001年中国科学院与教育部联合共建“水土保持与生态环境研究中心”，作为知识创新工程试点单位继续纳入中国科学院研究机构序列。
北京大学创办于1898年，初名京师大学堂，是中国第一所国立综合性大学，也是当时中国最高教育行政机关。辛亥革命后，于1912年改为现名。为将北大建设成为世界一流大学奠定了坚实的基础。今天的北京大学已经成为国家培养高素质、创造性人才的摇篮、科学研究的前沿和知识创新的重要基地和国际交流的重要桥梁和窗口。
中国科学院青藏高原研究所（以下简称“青藏高原所”）于2003年成立，是中科院党组根据国家经济社会发展重大战略需求和国际科学前沿发展趋势，在知识创新工程科技布局和组织结构调整中成立的研究所之一。研究所实行北京部、拉萨部和昆明部的“一所三部”运行模式，还在加德满都、伊朗、塔吉克建有海外科学中心。在首任所长姚檀栋院士的领导下，青藏高原所坚持“高水平、国际化、重服务”的建所理念，励精图治、艰苦创业，取得了一系列重要成果和重大突破，推动我国青藏高原研究事业进入了国际第一方阵。
中国科学院亚热带农业生态研究所自1978年任务建所以来，始终牢记使命，不断奋发进取，经过几代人的努力，为我国南方农业现代化道路的探索和亚热带区域农业可持续发展作出了重要贡献。特别是2002年进入中国科学院知识创新工程序列以来，在中国科学院“三个面向、四个率先”新的办院方针指引下，在“练内功卧薪尝胆，图创新众志成城”的研究所创新文化的引领下，围绕亚热带区域农业与生态环境协调发展的国家需求和地方经济建设，积极凝练学科方向和科学目标，强化农业生态研究平台建设，研究所快速发展成为有一定影响的亚热带区域农业生态领域的研究机构，为亚热带区域农业可持续发展与生态环境建设做出了卓越的贡献。
中国科学院沈阳应用生态研究所学科定位为以陆地生态系统为研究对象，以现代生态学为主攻学科，主要开展宏观生态学、系统生态学、实验生态学，生物工程与生物技术等领域的研究。沈阳生态所正式进入中国科学院知识创新工程试点，确立了森林生态与林业生态工程、土壤生态与农业生态工程、污染生态与环境生态工程三大领域的学科布局。建所以来，围绕国家农业、林业可持续发展、生态与环境建设中急需解决的重大问题和应用生态学的发展需要，沈阳生态所在森林生态与林业生态工程、土壤生态与农业生态工程、污染生态与环境生态工程领域开展基础性、战略性和前瞻性研究，丰富和发展森林生态学、农田生态学和污染生态学的基础理论，为我国主要退化生态系统恢复与重建，改善生态与环境，保障食物安全提供科学依据与关键技术。
中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）发展定位为：“面向我国人口健康和社会可持续发展的重大战略需求与生命科学前沿，重点研究基因组结构、变异、功能及其演化规律，加强基因组学与其他学科的交叉融合，发展基因组学的新理论、新方法和新技术，成为基因组学原始创新研究基地、创新人才培养基地和卓越科学中心，为保障人类社会的健康发展做出重大贡献”。基因组所成立以来，承担了“973”、“863”、国家自然科学基金重大项目和中科院知识创新工程等多项重大科研任务，取得了令人瞩目的成就，参与完成了国际人类基因组计划、单体型图计划；独立完成了中国超级杂交水稻基因组计划，牵头国家自然科学基金委“微进化过程中的多基因作用机制”重大研究计划和中科院中国人群精准医学研究计划等一系列重大科学项目。在肿瘤微进化、表观遗传学、精准医学、数据库建设等领域取得了突破性进展。
中国科学院科技创新发展中心围绕创新型国家建设面临的重大问题，发挥国家发展和改革委员会与中国科学院优势，在创新体系、创新能力、创新政策、创新管理等领域，组织重大研究与决策咨询，为政府宏观决策和制定政策以及推动企业创新能力建设提供重要支撑。中心近期任务：密切跟踪国内外创新发展基本理论、创新战略与政策、创新管理与方法等领域前沿发展态势及其应用实践，探索适合中国国情的创新发展理论。
中国科学院沈阳应用生态研究所学科定位为以陆地生态系统为研究对象，以现代生态学为主攻学科，主要开展宏观生态学、系统生态学、实验生态学，生物工程与生物技术等领域的研究。沈阳生态所正式进入中国科学院知识创新工程试点，确立了森林生态与林业生态工程、土壤生态与农业生态工程、污染生态与环境生态工程三大领域的学科布局。建所以来，围绕国家农业、林业可持续发展、生态与环境建设中急需解决的重大问题和应用生态学的发展需要，沈阳生态所在森林生态与林业生态工程、土壤生态与农业生态工程、污染生态与环境生态工程领域开展基础性、战略性和前瞻性研究，丰富和发展森林生态学、农田生态学和污染生态学的基础理论，为我国主要退化生态系统恢复与重建，改善生态与环境，保障食物安全提供科学依据与关键技术。
武汉理工大学材料复合新技术国家重点实验室，从事基础和高新技术研究的基地，知识创新、技术创新的基地，培养高层次人才的基地，国内外学术交流和多学科交叉研究的基地
中国科学院青藏高原研究所（以下简称“青藏高原所”）于2003年成立，是中科院党组根据国家经济社会发展重大战略需求和国际科学前沿发展趋势，在知识创新工程科技布局和组织结构调整中成立的研究所之一。研究所实行北京部、拉萨部和昆明部的“一所三部”运行模式，还在加德满都、伊朗、塔吉克建有海外科学中心。在首任所长姚檀栋院士的领导下，青藏高原所坚持“高水平、国际化、重服务”的建所理念，励精图治、艰苦创业，取得了一系列重要成果和重大突破，推动我国青藏高原研究事业进入了国际第一方阵。
地理信息科学与技术全国重点实验室致力于地球信息科学的基础理论与方法的研究，发展地理信息系统核心技术，构建国家级行业重大应用示范系统，建立“数据-模型-软件-系统”一体化的地球信息科学研究体系，对我国地球信息科学的发展起到学科导向、应用示范及骨干人才培养的作用。实验室成立以来，以承担国家重大科研任务和国际合作研究为重点，积极推进地球信息科学的发展。先后承担了300余项国家973、863、科技攻关、国家自然科学基金、中国科学院知识创新重大项目、省部级和国际合作研究课题，涉及空间分析与系统模拟、空间分布模式挖掘与地学知识发现、地球信息科学前沿技术与软件系统、地球系统科学数据集成与共享、资源与环境信息系统重大行业应用与示范等地球信息科学的各个领域。
中国科学院文献情报中心为中国科学院直属事业法人单位，立足中国科学院、面向全国，主要为自然科学、边缘交叉科学和高技术领域的科技自主创新提供文献信息保障、战略情报研究服务、公共信息服务平台支撑和科学交流与传播服务，同时通过国家科技图书文献平台和开展共建共享为国家创新体系其他领域的科研机构提供信息服务。围绕国家科技发展需求及中科院“率先行动”计划，积极建设分布式科技大数据知识资源体系，开展普惠的文献信息服务和覆盖创新价值链的情报服务，面向科技决策一线、面向科技创新一线、面向国家与区域科技发展，建立全院协同和有机嵌入科研和决策过程的知识服务体系是支撑我国科技发展的权威的国家科技知识服务中心。
理论物理所自进入知识创新试点工程基地以来，以探索自然界物质结构以及基本运动规律方面做出具有国际影响的重大创新成果为目标，对学科方向作了进一步的凝炼，形成了六个研究方向，研究领域涉及到物质起源和基本组元，宇宙起源和演化，生命起源和进化。
中国科学院亚热带农业生态研究所自1978年任务建所以来，始终牢记使命，不断奋发进取，经过几代人的努力，为我国南方农业现代化道路的探索和亚热带区域农业可持续发展作出了重要贡献。特别是2002年进入中国科学院知识创新工程序列以来，在中国科学院“三个面向、四个率先”新的办院方针指引下，在“练内功卧薪尝胆，图创新众志成城”的研究所创新文化的引领下，围绕亚热带区域农业与生态环境协调发展的国家需求和地方经济建设，积极凝练学科方向和科学目标，强化农业生态研究平台建设，研究所快速发展成为有一定影响的亚热带区域农业生态领域的研究机构，为亚热带区域农业可持续发展与生态环境建设做出了卓越的贡献。
北京大学创办于1898年，初名京师大学堂，是中国第一所国立综合性大学，也是当时中国最高教育行政机关。辛亥革命后，于1912年改为现名。为将北大建设成为世界一流大学奠定了坚实的基础。今天的北京大学已经成为国家培养高素质、创造性人才的摇篮、科学研究的前沿和知识创新的重要基地和国际交流的重要桥梁和窗口。
中国科学院文献情报中心为中国科学院直属事业法人单位，立足中国科学院、面向全国，主要为自然科学、边缘交叉科学和高技术领域的科技自主创新提供文献信息保障、战略情报研究服务、公共信息服务平台支撑和科学交流与传播服务，同时通过国家科技图书文献平台和开展共建共享为国家创新体系其他领域的科研机构提供信息服务。围绕国家科技发展需求及中科院“率先行动”计划，积极建设分布式科技大数据知识资源体系，开展普惠的文献信息服务和覆盖创新价值链的情报服务，面向科技决策一线、面向科技创新一线、面向国家与区域科技发展，建立全院协同和有机嵌入科研和决策过程的知识服务体系是支撑我国科技发展的权威的国家科技知识服务中心。
中国科学院信息工程研究所，面向国家战略需求，在信息安全科技领域，开展基础理论与前沿技术研究，开发应用性技术与系统，为国家信息化进程提供核心关键技术支撑与系统解决方案。主要研究方向是密码理论与安全协议、信息智能处理、数据安全、通信与电磁安全、网络与系统技术、信息系统测试评估技术等。目前承担了多项国家重大科技专项、国家973计划、863计划、科技支撑计划项目，国家自然科学基金项目，国家重大信息工程建设与中科院知识创新工程重大、重点项目。
